La roya de la paja, causada por f. sp., es una enfermedad altamente destructiva que prevalece en la mayoría de las regiones productoras de trigo a nivel mundial. La estrategia más efectiva para combatir esta enfermedad es a través de la explotación de genes de resistencia duraderos y robustos de los parientes del trigo. (Host) Barkworth y D.R. Dewey han sido ampliamente hibridizados con trigo común y se ha demostrado que son una fuente valiosa de genes que confieren resistencia y tolerancia contra los estreses bióticos y abióticos que afectan al trigo. En este estudio, se caracterizó de manera integral una nueva línea de adición de trigo-2StS.2JL, llamada Th93-1-6, que se originó de la línea de anfidiploide parcial de trigo, Th24-19-5, utilizando técnicas de hibridación de fluorescencia no desnaturalizante (ND-FISH) y técnicas de pintura Oligo-FISH. Para detectar plantas con la transferencia de genes de resistencia de Th93-1-6 a los cromosomas de trigo, se estudiaron 2384 plantas M-M del cruce entre Th93-1-6 y la variedad de trigo susceptible MY11 mediante ND-FISH utilizando múltiples sondas. Se identificaron un total de 37 tipos de aberraciones cromosómicas 2StS.2JL. Posteriormente, se desarrollaron 12 líneas homocigotas para construir un mapa binocional citológico. Se construyeron diez bins cromosómicos en el cromosoma 2StS.2JL basados en 84 marcadores moleculares específicos. Entre ellos, ocho líneas de aberración cromosómica alienígena, que contenían todas el bin 2StS-3, mostraron una resistencia mejorada a la roya de la paja. En consecuencia, el(los) gen(es) para la resistencia a la roya de la paja se mapeó físicamente a la región de 92.88-155.32 Mb de 2StS en las secuencias del genoma de referencia v2.1. Además, se espera que estas nuevas líneas de translocación de trigo-2StS.2JL sirvan como valiosos recursos genéticos en la mejora de cultivares de trigo resistentes a la roya.