Las auxinas son compuestos químicos de gran interés, principalmente debido a su papel en el metabolismo y desarrollo de las plantas. Las auxinas sintéticas se han utilizado como herbicidas durante más de 75 años y su baja toxicidad en los humanos es una de sus características más ventajosas. Se han realizado extensos estudios de auxinas naturales y sintéticas en un esfuerzo por comprender su papel en el crecimiento de las plantas. Sin embargo, los detalles moleculares del proceso de unión y reconocimiento siguen siendo una pregunta abierta. Aquí presentamos un exhaustivo pipeline in silico para la evaluación de ligandos de TIR1 utilizando varios métodos basados en la estructura. Nuestros resultados sugieren que las dinámicas sutiles dentro del bolsillo de unión surgen de las interacciones agua-ligando. También mostramos que este rasgo distingue a los ligandos efectivos. Finalmente, construimos una base de datos de ligandos putativos y compuestos señuelo, que pueden ayudar en estudios adicionales centrados en el diseño de auxinas sintéticas. Hasta donde sabemos, este estudio es el primero de su tipo centrado en TIR1.