Este estudio tuvo como objetivo caracterizar la diversidad genética y los rasgos morfológicos de 32 poblaciones recolectadas del Valle de Aniene. Los análisis cuantitativos de los rasgos de las semillas revelaron que los accesos de Mandolone exhibieron pesos y dimensiones de semillas significativamente mayores en comparación con los accesos de Fagiolone. Específicamente, los accesos de Mandolone mostraron un peso promedio de 189.48 g por 100 semillas, con alturas y longitudes de semillas promediando 14.38 mm y 23.84 mm, respectivamente. En contraste, los accesos de Fagiolone tuvieron un peso promedio de semilla de 174.13 g, con alturas y longitudes de semillas de 13.95 mm y 22.58 mm, respectivamente. El análisis molecular, realizado utilizando 9 loci SSR polimórficos, identificó 53 alelos en 320 genotipos, con una heterocigosidad esperada media (He) de 0.695. Esto indicó que había una alta variabilidad genética dentro de las poblaciones del Valle de Aniene. El análisis de diversidad genética reveló dos clústeres genéticos correspondientes a las variedades de Mandolone y Fagiolone. Esto fue respaldado por análisis UPGMA, PCoA y STRUCTURE. Este estudio destaca la necesidad de conservar la diversidad genética dentro de estas variedades y proporciona una base para el desarrollo de estrategias de conservación para los germoplasmas en el singular contexto ecológico del Valle de Aniene.