Caracterización de los Genomas de Plastidios de Cuatro Especies de Thunb. de Kazajistán
Autores: Almerekova, Shyryn; Yermagambetova, Moldir; Osmonali, Bektemir; Vesselova, Polina; Abugalieva, Saule; Turuspekov, Yerlan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Caracterización de los Genomas de Plastidios de Cuatro Especies de Thunb. de Kazajistán
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia
Chenopodiaceae
Genomas de plastidios
Salsoleae
Análisis filogenético
Especies
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La familia Chenopodiaceae Vent. (Amaranthaceae) es conocida por su complejidad taxonómica, que comprende especies de significativa importancia económica y ecológica. A pesar de su relevancia, la disponibilidad de datos del genoma plastidial para esta familia sigue siendo limitada. Este estudio involucró la ensamblaje y caracterización de los genomas plastidiales completos de cuatro especies de Thunb. dentro de la tribu Salsoleae, utilizando tecnología de secuenciación de nueva generación. Comparamos características del genoma, diversidad de nucleótidos y secuencias repetidas, y realizamos un análisis filogenético de diez especies de Salsoleae. El tamaño del genoma plastidial varió entre las cuatro especies, oscilando entre 150,777 pb y 151,307 pb. Cada genoma plastidial estudiado codificó 133 genes, incluyendo 114 genes únicos. Este conjunto de genes incluye 80 genes que codifican proteínas, 30 genes de tRNA y 4 genes de rRNA. Se identificaron ocho regiones divergentes en diez genomas plastidiales de Salsoleae, que podrían ser marcadores potenciales de código de barras de ADN. Además, se detectaron 1106 elementos repetidos, que consisten en 814 repeticiones de secuencia simple, 92 repeticiones en tándem, 88 repeticiones hacia adelante, 111 repeticiones palindrómicas y una repetición inversa. El análisis filogenético proporcionó un sólido apoyo para las relaciones dentro de las especies. Estos datos representan un recurso valioso para futuros estudios filogenéticos dentro del género.
Descripción
La familia Chenopodiaceae Vent. (Amaranthaceae) es conocida por su complejidad taxonómica, que comprende especies de significativa importancia económica y ecológica. A pesar de su relevancia, la disponibilidad de datos del genoma plastidial para esta familia sigue siendo limitada. Este estudio involucró la ensamblaje y caracterización de los genomas plastidiales completos de cuatro especies de Thunb. dentro de la tribu Salsoleae, utilizando tecnología de secuenciación de nueva generación. Comparamos características del genoma, diversidad de nucleótidos y secuencias repetidas, y realizamos un análisis filogenético de diez especies de Salsoleae. El tamaño del genoma plastidial varió entre las cuatro especies, oscilando entre 150,777 pb y 151,307 pb. Cada genoma plastidial estudiado codificó 133 genes, incluyendo 114 genes únicos. Este conjunto de genes incluye 80 genes que codifican proteínas, 30 genes de tRNA y 4 genes de rRNA. Se identificaron ocho regiones divergentes en diez genomas plastidiales de Salsoleae, que podrían ser marcadores potenciales de código de barras de ADN. Además, se detectaron 1106 elementos repetidos, que consisten en 814 repeticiones de secuencia simple, 92 repeticiones en tándem, 88 repeticiones hacia adelante, 111 repeticiones palindrómicas y una repetición inversa. El análisis filogenético proporcionó un sólido apoyo para las relaciones dentro de las especies. Estos datos representan un recurso valioso para futuros estudios filogenéticos dentro del género.