Caracterización de la familia de genes F-Box y su expresión bajo estrés osmótico en el abedul
Autores: Lv, Guanbin; Shi, Jingjing; Li, Jingnan; Liu, Guifeng; Yang, Chuanping; Jiang, Jing
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización de la familia de genes F-Box y su expresión bajo estrés osmótico en el abedul
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de genes f-box
Crecimiento de plantas
Procesos biológicos
Abeto
Estrés osmótico
Respuesta hormonal
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes F-box es abundante en plantas y crucial para el crecimiento y desarrollo de las mismas. Sin embargo, prevalecen dos preguntas: ¿Qué genes F-box están involucrados en la regulación de los procesos biológicos de las plantas? ¿Cómo regulan estos genes tales procesos biológicos? En este estudio, caracterizamos la familia F-box e identificamos 240 genes en el abeto (Suk.) a través del análisis HMMER. Según los dominios conservados en el extremo C-terminal, los miembros de F-box se dividieron en 10 subfamilias. A través del análisis filogenético, las proteínas F-box se agruparon en ocho ramas evolutivas. Los análisis de sinonimia sugirieron que la familia de genes F-box del abeto exhibe eventos de duplicación en tándem y segmental. El análisis de anotación GO reveló que las proteínas BpF-box responden a estímulos y regulan la respuesta de defensa. Según el análisis de RNA-Seq, encontramos que 11 genes expresados diferencialmente (DEGs) son sensibles al estrés osmótico. Realizamos un análisis de coexpresión en los genes representativos, y el análisis de enriquecimiento GO reveló además que los genes representativos de las plantas participan en la regulación de hormonas, crecimiento y desarrollo. A través de qRT-PCR, encontramos que los genes representativos están principalmente involucrados en las vías de señalización de respuesta a hormonas. Parece que la familia de genes F-box desempeña un papel significativo en la regulación de las respuestas al estrés osmótico del abeto a través de la regulación de diferentes hormonas. Nuestros resultados proporcionaron nuevas perspectivas sobre la función biológica de las proteínas BpF-box.
Descripción
La familia de genes F-box es abundante en plantas y crucial para el crecimiento y desarrollo de las mismas. Sin embargo, prevalecen dos preguntas: ¿Qué genes F-box están involucrados en la regulación de los procesos biológicos de las plantas? ¿Cómo regulan estos genes tales procesos biológicos? En este estudio, caracterizamos la familia F-box e identificamos 240 genes en el abeto (Suk.) a través del análisis HMMER. Según los dominios conservados en el extremo C-terminal, los miembros de F-box se dividieron en 10 subfamilias. A través del análisis filogenético, las proteínas F-box se agruparon en ocho ramas evolutivas. Los análisis de sinonimia sugirieron que la familia de genes F-box del abeto exhibe eventos de duplicación en tándem y segmental. El análisis de anotación GO reveló que las proteínas BpF-box responden a estímulos y regulan la respuesta de defensa. Según el análisis de RNA-Seq, encontramos que 11 genes expresados diferencialmente (DEGs) son sensibles al estrés osmótico. Realizamos un análisis de coexpresión en los genes representativos, y el análisis de enriquecimiento GO reveló además que los genes representativos de las plantas participan en la regulación de hormonas, crecimiento y desarrollo. A través de qRT-PCR, encontramos que los genes representativos están principalmente involucrados en las vías de señalización de respuesta a hormonas. Parece que la familia de genes F-box desempeña un papel significativo en la regulación de las respuestas al estrés osmótico del abeto a través de la regulación de diferentes hormonas. Nuestros resultados proporcionaron nuevas perspectivas sobre la función biológica de las proteínas BpF-box.