La cáscara del fruto de pequi, a pesar de ser frecuentemente desechada, tiene un alto contenido de compuestos bioactivos y, por lo tanto, un alto valor nutricional. El presente estudio tuvo como objetivo explorar las bioactividades en la cáscara de pequi, particularmente sus posibles beneficios para la salud a nivel de actividad antioxidante. La explotación de esta fruta también podría presentar beneficios económicos significativos y las aplicaciones de los subproductos del pequi representarían una reducción de residuos, teniendo un impacto positivo en el medio ambiente. Se identificaron compuestos fenólicos presentes en el exocarpo y mesocarpo externo del pequi mediante espectrometría de masas por spray en papel (PS-MS) y se cuantificaron por HPLC. El contenido total de fenoles (TPC) junto con la cantidad de 2,2-difenil-1-picrilhidrazilo (DPPH), el Poder Antioxidante Reductor Férrico (FRAP) y la cantidad de 2,2-azino-bis(3-etilbenzotiazolina-6-ácido sulfónico) (ABTS) también se determinaron en los extractos de cáscara. La epicatequina fue el compuesto fenólico más abundante encontrado, seguida de los ácidos cafeico, salicílico y gálico. Además, la huella dactilar reveló compuestos relacionados con varios efectos beneficiosos para la salud. En resumen, los resultados obtenidos fueron alentadores para las posibles aplicaciones de la cáscara de pequi en el campo de los alimentos funcionales.