Caracterización comparativa de y basado en sus peculiaridades del repetoma
Autores: Kroupin, Pavel Yu.; Yurkina, Anna I.; Ulyanov, Daniil S.; Karlov, Gennady I.; Divashuk, Mikhail G.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Caracterización comparativa de y basado en sus peculiaridades del repetoma
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Especies
Repeticiones de satélites
Repetomas
Cambios evolutivos
Cromosomas
Genoma St
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
las especies juegan un papel importante entre los pastos, ya que son los donantes putativos del genoma St en muchas especies poliploides. Los repeticiones satelitales se utilizan ampliamente como una herramienta confiable para rastrear cambios evolutivos porque están distribuidos a lo largo de los genomas de las plantas. El objetivo de nuestro trabajo es realizar una caracterización comparativa de los repetomas de las especies estrechamente relacionadas y , y también se incluyó en el análisis. Las estructuras generales del repetoma de , , y eran similares, con algunas peculiaridades individuales observadas en la abundancia de los retrotransposones (Ty1/) y transposones, y satélites. Se identificaron nueve nuevas repeticiones satelitales a partir de las secuencias de genoma completo de y , así como la repetición CL244 que se encontró previamente en , que fueron localizadas en los cromosomas de y . Cuatro repeticiones satelitales (CL69, CL101, CL119, CL244) demostraron localización terminal y/o distal, mientras que seis repeticiones (CL82, CL89, CL168, CL185, CL192, CL207) fueron pericentroméricas. Basado en los resultados obtenidos, se puede suponer que y son especies estrechamente relacionadas, aunque tienen peculiaridades individuales en sus estructuras de repetoma y patrones de localización de repeticiones satelitales en los cromosomas. Se discute el destino evolutivo de las repeticiones satelitales identificadas y sus secuencias relacionadas, así como su distribución en los cromosomas de las especies. Los marcadores cromosómicos del genoma St desarrollados en la presente investigación pueden ser útiles en estudios de población de y ; auto- y alopoliploides que contienen el genoma St, como , , , y ; y híbridos amplios entre el trigo y especies silvestres relacionadas.
Descripción
las especies juegan un papel importante entre los pastos, ya que son los donantes putativos del genoma St en muchas especies poliploides. Los repeticiones satelitales se utilizan ampliamente como una herramienta confiable para rastrear cambios evolutivos porque están distribuidos a lo largo de los genomas de las plantas. El objetivo de nuestro trabajo es realizar una caracterización comparativa de los repetomas de las especies estrechamente relacionadas y , y también se incluyó en el análisis. Las estructuras generales del repetoma de , , y eran similares, con algunas peculiaridades individuales observadas en la abundancia de los retrotransposones (Ty1/) y transposones, y satélites. Se identificaron nueve nuevas repeticiones satelitales a partir de las secuencias de genoma completo de y , así como la repetición CL244 que se encontró previamente en , que fueron localizadas en los cromosomas de y . Cuatro repeticiones satelitales (CL69, CL101, CL119, CL244) demostraron localización terminal y/o distal, mientras que seis repeticiones (CL82, CL89, CL168, CL185, CL192, CL207) fueron pericentroméricas. Basado en los resultados obtenidos, se puede suponer que y son especies estrechamente relacionadas, aunque tienen peculiaridades individuales en sus estructuras de repetoma y patrones de localización de repeticiones satelitales en los cromosomas. Se discute el destino evolutivo de las repeticiones satelitales identificadas y sus secuencias relacionadas, así como su distribución en los cromosomas de las especies. Los marcadores cromosómicos del genoma St desarrollados en la presente investigación pueden ser útiles en estudios de población de y ; auto- y alopoliploides que contienen el genoma St, como , , , y ; y híbridos amplios entre el trigo y especies silvestres relacionadas.