Caracterización basada en el pan-genoma de la familia de factores de transcripción PYL en
Autores: Han, Xiaoli; Qiu, Chen; Gai, Zhongshuai; Zhai, Juntuan; Song, Jia; Sun, Jianhao; Li, Zhijun
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Caracterización basada en el pan-genoma de la familia de factores de transcripción PYL en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
ácido abscísico
Resistencia a pyrabactina 1
Proteínas similares a PYR1
Análisis filogenético
Selección purificadora
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
El ácido abscísico (ABA) es una fitohormona clave involucrada en la regulación del crecimiento de las plantas y las respuestas al estrés ambiental. Como receptores de ABA, las proteínas de resistencia a la pirabactina 1 (PYR)/similares a PYR1 (PYL) desempeñan un papel central en la iniciación de la transducción de señales de ABA. En este estudio, se identificaron un total de 30 genes y se clasificaron en tres subfamilias (PYL I-III) en el pan-genoma de 17 especies, a través de un análisis filogenético. Entre estas subfamilias, la subfamilia PYL I fue la más grande, compuesta por 21 miembros, mientras que la PYL III fue la más pequeña, con solo cuatro miembros. Para elucidar la dinámica evolutiva de estos genes, realizamos análisis de sinonimia y /. Los resultados indicaron que la mayoría de los genes habían pasado por una selección purificadora (/ < 1), mientras que unos pocos estaban sujetos a selección positiva (/ > 1). El análisis de promotores reveló 258 elementos reguladores en los genes de (EUP) y (PRU), incluidos 127 elementos sensibles al estrés abiótico y 33 elementos relacionados con ABA. Además, se detectaron seis variaciones estructurales (SVs) en los genes que influyeron significativamente en los niveles de expresión génica (< 0.05). Para explorar más a fondo los roles funcionales de los genes, analizamos los perfiles de expresión específicos de tejidos de 17 genes bajo condiciones de estrés por sequía. se expresó predominantemente en raíces, exhibió expresión específica en hojas y mostró una expresión elevada en tallos. Estos hallazgos sugieren que la respuesta a la sequía de los genes es específica del tejido. En general, este estudio destaca la utilidad de la pan-genómica para elucidar la evolución de las familias de genes y sugiere que los genes contribuyen a la regulación de las respuestas al estrés por sequía en EUP, ofreciendo valiosos recursos genéticos para la caracterización funcional de los genes.
Descripción
El ácido abscísico (ABA) es una fitohormona clave involucrada en la regulación del crecimiento de las plantas y las respuestas al estrés ambiental. Como receptores de ABA, las proteínas de resistencia a la pirabactina 1 (PYR)/similares a PYR1 (PYL) desempeñan un papel central en la iniciación de la transducción de señales de ABA. En este estudio, se identificaron un total de 30 genes y se clasificaron en tres subfamilias (PYL I-III) en el pan-genoma de 17 especies, a través de un análisis filogenético. Entre estas subfamilias, la subfamilia PYL I fue la más grande, compuesta por 21 miembros, mientras que la PYL III fue la más pequeña, con solo cuatro miembros. Para elucidar la dinámica evolutiva de estos genes, realizamos análisis de sinonimia y /. Los resultados indicaron que la mayoría de los genes habían pasado por una selección purificadora (/ < 1), mientras que unos pocos estaban sujetos a selección positiva (/ > 1). El análisis de promotores reveló 258 elementos reguladores en los genes de (EUP) y (PRU), incluidos 127 elementos sensibles al estrés abiótico y 33 elementos relacionados con ABA. Además, se detectaron seis variaciones estructurales (SVs) en los genes que influyeron significativamente en los niveles de expresión génica (< 0.05). Para explorar más a fondo los roles funcionales de los genes, analizamos los perfiles de expresión específicos de tejidos de 17 genes bajo condiciones de estrés por sequía. se expresó predominantemente en raíces, exhibió expresión específica en hojas y mostró una expresión elevada en tallos. Estos hallazgos sugieren que la respuesta a la sequía de los genes es específica del tejido. En general, este estudio destaca la utilidad de la pan-genómica para elucidar la evolución de las familias de genes y sugiere que los genes contribuyen a la regulación de las respuestas al estrés por sequía en EUP, ofreciendo valiosos recursos genéticos para la caracterización funcional de los genes.