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Caracterización a nivel genómico de la familia de genes en

Autores: Ji, Kang; Liu, Cuiyu; Wu, Kaiyun; Yue, Zhihui; Dong, Yi; Gong, Bangchu; Xu, Yang

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Caracterización a nivel genómico de la familia de genes en


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales

Palabras clave

Familia génica
Subfamilia
Dominio MYB
Secuencia del genoma
Perfiles de expresión
Tanino soluble

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 18

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La familia de genes es una de las familias de factores de transcripción más grandes, que se agrupa en cuatro subfamilias según el número de repeticiones de secuencias de aminoácidos imperfectas en su dominio MYB conservado. es la subfamilia más grande que desempeña un papel diverso en el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como en las tensiones adversas. tiene una amplia gama de aplicaciones en ciencias biomédicas y en las industrias alimentaria, maderera y química. Entre estas especies, se puede utilizar como planta modelo para el género y la familia Ebenaceae. Aunque la secuencia del genoma de fue publicada recientemente en nuestro trabajo anterior, el análisis de bioinformática y el patrón de expresión de la familia de genes son limitados. Aquí presentamos los hallazgos de un análisis a nivel genómico y los perfiles de expresión del factor de transcripción R2R3-MYB en . Se identificaron un total de 129 genes y se clasificaron en 28 grupos (C1-C28) que tenían motivos conservados. Los genes de la subfamilia estaban distribuidos de manera desigual en 15 cromosomas; los cromosomas 6 y 7 tienen la mayoría de los genes. Se identificaron un total de 44 eventos de replicación de fragmentos que contenían 57 genes mediante análisis de sintenia. Además, el análisis colineal reveló que 70 (54%) pares de genes de eran colineales con . Al combinar los datos de RNA-seq y qRT-PCR, se seleccionaron e identificaron cuatro genes clave que se correlacionaron con el contenido de taninos solubles durante el desarrollo de la fruta. puede estar relacionado con la síntesis de taninos solubles en el caqui. Estos resultados sientan una base importante para futuros estudios sobre la función del gen en el desarrollo de la fruta de caqui.

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