Las enfermedades postcosecha causadas por varios patógenos fúngicos representan una amenaza significativa para la calidad de la fruta, el almacenamiento y el valor de mercado, lo que hace que su identificación y caracterización biológica sean esenciales para estrategias de manejo efectivas. Este estudio examina las características morfológicas y filogenéticas de las especies asociadas con la pudrición del fruto de níspero en Yunnan, China. En mayo de 2023, la pudrición del fruto de níspero en Yunnan, China, se clasificó en cuatro tipos: pudrición anular, mancha marrón, mancha negra y pudrición blanda, con tasas de incidencia del 4%, 6%, 6% y 12%, respectivamente. Basado en características morfológicas y enfoques moleculares, se identificaron dos cepas como causantes de la pudrición anular. Tres cepas se identificaron como responsables de las manchas marrones. Tres cepas se identificaron como causantes de la aparición de manchas negras en las hojas. De manera similar, se identificaron dos cepas como causantes de la pudrición blanda. Todas las especies identificadas fueron verificadas para inducir la pudrición del fruto de níspero mediante la validación de los postulados de Koch. Este es el informe novedoso de las especies que inducen la pudrición postcosecha del fruto en níspero en Yunnan, China, y a nivel mundial. También es la primera evidencia de que causa pudrición postcosecha del fruto y mancha gris en las hojas de níspero en Yunnan, China. La virulencia difería entre especies, incluso dentro de los aislados de la misma especie. Además, el efecto de la temperatura sobre la patogenicidad en las hojas de níspero fue mayor que la humedad. Estos hallazgos mejoran nuestra comprensión de los patógenos fúngicos que afectan el fruto de níspero en el área de estudio y destacan la importancia de estrategias de manejo efectivas para minimizar la pudrición de la fruta. Se necesita más investigación para investigar los impactos ecológicos de estas especies y las posibles medidas de control en las prácticas agrícolas.