Hoy en día, los datos de teledetección hiperespectral se utilizan ampliamente en la gestión de nutrientes, la previsión de rendimientos de cultivos y el monitoreo de estrés. Estos datos se pueden adquirir con satélites, drones y espectrómetros portátiles. En esta investigación, los datos del espectrómetro portátil fueron validados mediante mediciones de fluorescencia de clorofila-a bajo estrés frío natural. Se monitoreó el rendimiento de 16 cultivares de arroz con diferentes orígenes y tolerancias en la etapa de plántula. Los estudios se llevaron a cabo en condiciones de campo a lo largo de dos temporadas para simular diferentes regímenes de temperatura. Se compararon veinticuatro índices espectrales y once parámetros de fluorescencia de clorofila-a rápida con plantas albinas. Identificamos qué longitudes de onda se ven afectadas por bajas temperaturas. Además, las diferencias entre genotipos se caracterizaron mediante ciertos índices bien conocidos y dos índices recién desarrollados (AAR y RAR) basados en la diferencia espectral entre el genotipo y la planta albina. Las diferencias de absorbancia, reflectancia y transmitancia respecto al control son adecuadas para la discriminación de variedades tolerantes-sensibles, especialmente basadas en su forma, pico y distancia de desplazamiento. Las siguientes longitudes de onda son capaces de determinar las variedades tolerantes, a saber, 548-553 nm, 667-670 nm, 687-688 nm y 800-950 nm en el caso de la absorbancia; por encima de 700 nm para la reflectancia; y todo el espectro (400-1100 nm) para la transmitancia.