El presente estudio se centra en la estructura y función de la comunidad fitoplanctónica durante períodos de cambios marcados en las características hidrológicas, influenciados por un evento climático atípico (La Niña) y su impacto en el embalse Armando Ribeiro Gonçalves de Rio Grande do Norte, situado en el bioma de la Caatinga, en el noreste de Brasil. Las principales preguntas abordadas fueron: ¿Cuáles son los efectos de los factores ambientales en la variación temporal del Grupo Funcional de Base Morfológica (MBFG) de la comunidad fitoplanctónica? ¿Cómo cambia la composición de las especies de cianobacterias en relación con las tendencias altas y bajas de la diversidad fitoplanctónica? Las muestras se recolectaron mensualmente durante 2008-2009 y se analizaron para determinar pH, temperatura, conductividad eléctrica, contenido de oxígeno disuelto y nutrientes como nitrógeno nítrico, nitrógeno amoniacal, nitrógeno total y ortofosfato. Se recolectaron muestras de fitoplancton para análisis cualitativos y cuantitativos con el fin de evaluar el índice de riqueza y diversidad de especies. Los datos se dividieron en dos períodos hidrodinámicos distintos: inestabilidad y estabilidad. Los resultados demuestran cambios considerables en el contenido de oxígeno disuelto, la transparencia del agua y los nutrientes nitrogenados, lo que influyó directamente en la MBFG de la comunidad fitoplanctónica en el espacio y el tiempo. La inestabilidad del agua del embalse se debió a las fuertes lluvias, que generan perturbaciones externas atípicas. La variación estacional de la MBFG demuestra un cambio en la composición de las cianobacterias y su diversidad durante los períodos de inestabilidad y estabilidad. La MBFG VII, compuesta por cianobacterias coloniales con mucílago, se asoció con valores reducidos de conductancia eléctrica y alteraciones del pH. El predominio de especies filamentosas con heterocistos (MBFG III) se produce únicamente durante el período de estabilidad hidrodinámica y no mostró una asociación significativa con los parámetros analizados. La codominancia de las MBFG III, V y VII, junto con una alta diversidad de especies de la comunidad fitoplanctónica, se produjo durante el segundo período de inestabilidad hidrodinámica, que se asoció con la reducción de la temperatura del agua. Se concluye que la disminución del predominio de especies de cianobacterias y el aumento general de la diversidad de la comunidad fitoplanctónica se ven influenciados por la anomalía pluvial. El aumento del nivel del agua durante el período de anomalía pluvial provocó un pulso de nutrientes y la mezcla de la columna de agua en el embalse, lo que determinó la distribución de la comunidad fitoplanctónica del MBPG.