El fósforo es crucial para el crecimiento y desarrollo de las plantas, pero el exceso de fertilizante no absorbido por las plantas a menudo se une a iones metálicos como el hierro y el manganeso, formando compuestos insolubles que contribuyen a la contaminación ambiental del suelo. Este estudio investiga el impacto de sp., una bacteria solubilizadora de fosfatos utilizada como biofertilizante, en la fertilidad del suelo, junto con los cambios asociados en los metabolitos del suelo y su relación con las comunidades microbianas después de la inoculación. Las estructuras de las comunidades microbianas del suelo y los perfiles de metabolitos se analizaron mediante secuenciación de amplicones y metabolómica no dirigida de alta resolución. La inoculación de bacterias solubilizadoras de fosfatos llevó a un aumento significativo (< 0.05) en las concentraciones de fósforo total, potasio y nitrógeno en el suelo, con un aumento notable en el fósforo disponible en el suelo en general (< 0.05). Además, la estructura de la comunidad microbiana mostró cambios significativos, particularmente en la abundancia de filos bacterianos como Acidobacteria, Chloroflexi, Proteobacteria y el filo fúngico Ascomycota. El análisis metabolómico reveló metabolitos distintos, incluidos ácidos grasos, hormonas, aminoácidos y compuestos relacionados con medicamentos. Taxones microbianos clave como Chloroflexi, Proteobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Mucoromycota y Ascomycota contribuyeron indirectamente al metabolismo del fósforo en el suelo al influir en estos metabolitos diferenciales. En conclusión, la aplicación de bacterias solubilizadoras de fosfatos ofrece un enfoque innovador para mejorar la calidad del suelo, promoviendo la eficiencia en la utilización del fósforo y mejorando la salud del ecosistema del suelo al optimizar las comunidades microbianas y las composiciones de metabolitos.