En los lechones, la microbiota intestinal madura de manera específica por segmentos durante el período de lactancia, mientras que los estudios basados en heces proporcionan una resolución funcional limitada en los sitios intestinales. Perfilamos el íleon utilizando secuenciación del gen 16s rRNA y evaluamos las funciones segmentales mediante metagenómica de disparo a edades seleccionadas. La riqueza y diversidad de especies en el íleon fueron relativamente estables a lo largo de los días. Fueron prominentes a partir del día 7, con taxones asociados a etapas que incluían . A través del análisis funcional metagenómico, a los 21 días, los genes se enriquecieron en el metabolismo del butanoato, y como un potencial probiótico desempeñó un papel importante en ello. A los 28 días, el análisis metagenómico indicó una mayor abundancia relativa en el íleon de vías relacionadas con el metabolismo de cisteína y metionina y la biosíntesis de lisina, en gran parte llevadas por . Estos datos describen la composición y función del íleon en los intestinos de los lechones e indican un período de diferenciación alrededor del día 21 al día 28.