El estrés por sequía puede afectar negativamente la germinación de semillas y el crecimiento de plántulas de trigo. Este estudio analizó el efecto de la sequía en la germinación de semillas y los parámetros morfológicos de plántulas de diez genotipos de trigo de invierno. El enfoque principal fue elucidar los efectos de dos intensidades de sequía en el estado metabólico de las plántulas de trigo. Los hallazgos sugieren que la mayoría de los genotipos de trigo mostraron una reducción significativa en las características de germinación y crecimiento bajo sequía severa, mientras que el genotipo Srpanjka mostró una menor reducción en ambas condiciones de sequía. De 668 características metabólicas, 54 se alteraron bajo estrés de 10% PEG y 140 bajo estrés de 20% PEG, con 48 compartidas entre estas dos intensidades de estrés. Este estudio demostró que la respuesta metabólica de los brotes al estrés de 10% PEG contrasta con la de 20% PEG. Algunos metabolitos de crecimiento, como el ácido oxálico, la sofurose y la turanosa, mostraron el mayor aumento positivo bajo ambos estrés, mientras que el ácido butanoico, el ácido trópico, la glicina, el ácido propiónico y el ácido fosfonoacético disminuyeron. Se sugiere que la acumulación de aminoácidos, como la prolina, contribuyó a la tolerancia a la sequía de las plantas. Entre todos los ácidos orgánicos, los ácidos succínico y aspártico aumentaron particularmente la respuesta de la planta al estrés por sequía leve y severa, respectivamente. Nuestros resultados sugieren que diferentes metabolitos en las plántulas de trigo mejoran la capacidad potencial del trigo para hacer frente al estrés por sequía en las primeras etapas de crecimiento al activar un mecanismo de tolerancia rápido y completo. Este descubrimiento presenta un nuevo enfoque para mejorar la tolerancia del trigo al estrés abiótico, incluido el déficit de agua.