En respuesta al importante daño ecológico causado por prácticas mineras insostenibles en las Montañas Qilian, se han llevado a cabo proyectos de restauración ecológica en los últimos años. Analizar los cambios en las comunidades microbianas del suelo durante el proceso de restauración de praderas mineras ayuda a revelar el mecanismo del proceso de restauración en áreas mineras alpinas. Para explorar las características de la distribución de la comunidad microbiana del suelo y sus relaciones con los factores ambientales del suelo durante la restauración de pastizales alpinos en las Montañas Qilian, realizamos encuestas y análisis en dos niveles de restauración, restauración baja (LR) y restauración alta (HR) en las Montañas Qilian orientales, junto con un control de pastizales naturales no perturbados (NG). Encontramos que a medida que aumenta el grado de recuperación de áreas mineras de gran altitud, hubo aumentos significativos en la cobertura vegetal, altura de la vegetación, biomasa sobre el suelo, índice de Shannon-Wiener de la vegetación, carbono orgánico del suelo (SOC), contenido de agua del suelo (SWC), nitrógeno total (TN), fósforo total (TP), potasio total (TK), fósforo disponible (AP) y nitrógeno disponible (AN). Por el contrario, el pH del suelo y la conductividad eléctrica (EC) disminuyeron significativamente, con el pH del suelo disminuyendo de 6.93 a 4.13. La restauración de pastizales de áreas mineras de gran altitud altera significativamente la distribución y composición de bacterias y hongos del suelo, mientras que el impacto en los cambios de la comunidad microbiana del suelo no fue significativo. Especialmente, con el aumento del nivel de recuperación, las filas bacterianas dominantes son Acidobacteria y Proteobacteria, mientras que las filas fúngicas dominantes son Ascomycota y Basidiomycota. Estos resultados indican que los cambios en la vegetación y las propiedades del suelo afectan la composición de las comunidades microbianas del suelo, siendo las propiedades del suelo las que tienen una mayor influencia. La fertilidad del suelo y los niveles de nutrientes emergen como los principales impulsores que influyen en las comunidades de composición microbiana del suelo y en el grado de recuperación de los pastizales de áreas mineras de gran altitud.