El cambio climático y las actividades humanas han cambiado considerablemente los patrones espaciales y los elementos funcionales de los hábitats regionales. Comprender los cambios espaciotemporales en la calidad del hábitat (HQ) y sus posibles factores impulsores es esencial para mantener la salud del ecosistema y proteger la biodiversidad. Para explorar el efecto de los factores físicos y humanos en los cambios de HQ en el suroeste de China, primero analizamos la intensidad del cambio de uso del suelo (LCI). Luego evaluamos los cambios espaciotemporales en HQ basándonos en el modelo InVEST y exploramos la heterogeneidad espacial de los principales factores impulsores de los cambios de HQ basándonos en un detector geográfico y un modelo de regresión ponderada geográficamente. Los resultados mostraron que LCI tenía diferencias espaciotemporales obvias, y LCI de hábitat de baja calidad a hábitat de alta calidad (LCI1) fue significativamente mayor que el de hábitat de alta calidad a hábitat de baja calidad (LCI2). La HQ mejoró de manera constante en el suroeste de China entre 1990 y 2015, mostrando una tendencia de bajo-alto-bajo de sureste a noroeste. Además, hubo doce factores, incluyendo la biomasa aérea, la proporción de área de tierras ecológicas, la densidad de población, la pendiente, etc., que tuvieron un impacto significativo en las diferencias espaciales en HQ, y los efectos de diferentes factores en HQ mostraron una heterogeneidad espacial observable. El efecto de LCI2 en la diferencia espacial de HQ fue mayor que el de LCI1. Estos resultados sugieren que la actual política de protección y gestión de ecosistemas tuvo un efecto positivo en la mejora de HQ. Nuestro estudio proporciona una referencia importante para la toma de decisiones en el desarrollo y utilización sostenible de la tierra y la protección y restauración ecológica regional.