La modelización matemática fiable de la migración secundaria de petróleo que incorpora la geología estructural y las rocas madre maduras en el modelo de cuenca, permite predecir la ubicación del reservorio, lo que resulta en una mejora significativa de la probabilidad de éxito en la exploración. Investigamos la migración secundaria de petróleo con una diferencia de composición significativa entre la roca madre y los reservorios de petróleo. En nuestro estudio de caso, el período de migración secundaria es significativamente más corto que el tiempo de generación del pulso de hidrocarburos. Por lo tanto, ni la adsorción ni la dispersión de componentes pueden explicar la diferencia de concentración entre la roca madre y el reservorio. Por primera vez, el presente artículo propone la filtración en lecho profundo de hidrocarburos con retención de cinética de componentes por la roca como un mecanismo físico que explica la graduación composicional. La introducción de la tasa de captura de componentes en la ecuación de transporte de balance de masa facilita la coincidencia de la diferencia de concentración para los hidrocarburos pesados, y los coeficientes de filtración ajustados varían en su rango común. Los valores obtenidos de los coeficientes de filtración aumentan monótonamente con el peso molecular y, en consecuencia, afectan el tamaño del componente oleico, como lo predice el modelo analítico de filtración en lecho profundo. La modelización muestra un efecto negligible de la dispersión de componentes en la graduación composicional.