Con el lanzamiento de la política nacional de ahorro de energía y reducción de emisiones y la mejora de la conciencia de los consumidores sobre la protección del medio ambiente, la demanda de productos de bajo carbono está creciendo rápidamente. En una cadena de suministro de bajo carbono liderada por minoristas, el aumento de los costos de reducción de emisiones de carbono pone a los fabricantes en desventaja. Bajo la política de cuotas de carbono, para mejorar las ganancias de los fabricantes y mejorar la reducción de emisiones de carbono, este documento estudia las decisiones de los actores en una cadena de suministro de bajo carbono que consta de un minorista dominante y un fabricante. Para mantener la estabilidad y sostenibilidad de la cadena de suministro, el minorista dominante tiende a emplear políticas de preferencia altruista hacia el fabricante. Se comparan y analizan la decisión óptima, la reducción de emisiones de carbono y el beneficio de la cadena de suministro bajo tres modelos de decisión: (i) decisión centralizada, (ii) decisión descentralizada sin preferencia altruista y (iii) decisión descentralizada con preferencia altruista. Los resultados indican que la tasa de reducción de emisiones de carbono, la demanda del mercado y el beneficio en el modelo centralizado son mayores que en el modelo descentralizado. La preferencia altruista del minorista es beneficiosa para la mejora de la reducción de emisiones de carbono, la demanda del mercado y el beneficio del fabricante y la cadena de suministro. Bajo ciertas condiciones, el comercio de carbono puede reducir efectivamente la presión de costos de los fabricantes y mejorar el nivel de reducción de emisiones de carbono y el beneficio general de la cadena de suministro. Estos resultados guiarán la toma de decisiones en la cadena de suministro de bajo carbono y proporcionarán información sobre la investigación de comportamientos irracionales en la toma de decisiones de la cadena de suministro bajo políticas de carbono.