Análisis de asociación de todo el genoma para la búsqueda de genes de calidad relacionados con los ácidos linoleico y linolénico en soja
Autores: Wang, Jiabao; Liu, Lu; Zhang, Qi; Sun, Tingting; Wang, Piwu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Análisis de asociación de todo el genoma para la búsqueda de genes de calidad relacionados con los ácidos linoleico y linolénico en soja
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Grasa de soja
ácidos grasos
ácido linoleico
ácido linolénico
Análisis de asociación a nivel genómico
Polimorfismos de nucleótido único
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 34
Citaciones: Sin citaciones
La grasa de soja contiene cinco ácidos grasos principales, y su composición de ácidos grasos y valor nutricional dependen del tipo de aceite de soja, la duración y condiciones de almacenamiento. Entre los contenidos de grasa, los ácidos grasos poliinsaturados, como el ácido linoleico y el ácido linolénico, juegan un papel esencial en el mantenimiento de las actividades humanas; por lo tanto, aumentar las proporciones de los contenidos de ácido linoleico y ácido linolénico puede ayudar a mejorar el valor nutricional del aceite de soja. Nuestro laboratorio completó la secuenciación del genoma completo SLAF-seq de la población natural (292 variedades de soja) en el período de crecimiento anterior. En este estudio, se realizó un análisis de asociación a nivel genómico (GWAS) basado en los datos genotípicos de la población natural y los datos fenotípicos de tres años de los contenidos de ácido linoleico y ácido linolénico de la soja, y se detectó repetidamente un locus de polimorfismos de nucleótido único (SNPs) significativo () asociado con el contenido de ácido oleico de la soja durante un período de 3 años utilizando el modelo GLM y el modelo MLM. Además, otro locus de SNP significativo () correlacionado con el ácido linolénico de la soja fue identificado a través de los mismos modelos. Se escanearon y analizaron los genes dentro del intervalo de 100 Kb aguas arriba y aguas abajo de los loci de SNP para su anotación funcional y enriquecimiento, y se seleccionaron un gen relacionado con la síntesis de ácido linoleico de la soja () y un gen relacionado con la síntesis de ácido linolénico (). Las expresiones de los genes candidatos se verificaron utilizando qRT-PCR, y basándose en los resultados de la verificación, se hipotetizó que y regulan positivamente la síntesis y acumulación de ácido linoleico y ácido linolénico, respectivamente. El estudio anterior sienta las bases para validar aún más las funciones génicas, y analizar los mecanismos reguladores de la síntesis y acumulación de ácido linoleico y ácido linolénico en la soja.
Descripción
La grasa de soja contiene cinco ácidos grasos principales, y su composición de ácidos grasos y valor nutricional dependen del tipo de aceite de soja, la duración y condiciones de almacenamiento. Entre los contenidos de grasa, los ácidos grasos poliinsaturados, como el ácido linoleico y el ácido linolénico, juegan un papel esencial en el mantenimiento de las actividades humanas; por lo tanto, aumentar las proporciones de los contenidos de ácido linoleico y ácido linolénico puede ayudar a mejorar el valor nutricional del aceite de soja. Nuestro laboratorio completó la secuenciación del genoma completo SLAF-seq de la población natural (292 variedades de soja) en el período de crecimiento anterior. En este estudio, se realizó un análisis de asociación a nivel genómico (GWAS) basado en los datos genotípicos de la población natural y los datos fenotípicos de tres años de los contenidos de ácido linoleico y ácido linolénico de la soja, y se detectó repetidamente un locus de polimorfismos de nucleótido único (SNPs) significativo () asociado con el contenido de ácido oleico de la soja durante un período de 3 años utilizando el modelo GLM y el modelo MLM. Además, otro locus de SNP significativo () correlacionado con el ácido linolénico de la soja fue identificado a través de los mismos modelos. Se escanearon y analizaron los genes dentro del intervalo de 100 Kb aguas arriba y aguas abajo de los loci de SNP para su anotación funcional y enriquecimiento, y se seleccionaron un gen relacionado con la síntesis de ácido linoleico de la soja () y un gen relacionado con la síntesis de ácido linolénico (). Las expresiones de los genes candidatos se verificaron utilizando qRT-PCR, y basándose en los resultados de la verificación, se hipotetizó que y regulan positivamente la síntesis y acumulación de ácido linoleico y ácido linolénico, respectivamente. El estudio anterior sienta las bases para validar aún más las funciones génicas, y analizar los mecanismos reguladores de la síntesis y acumulación de ácido linoleico y ácido linolénico en la soja.