El ácido oleico alto en cacahuate (HOAP) es ampliamente aceptado en China debido a su alto valor nutricional y a su mayor estabilidad oxidativa. Sin embargo, su difusión se ha visto severamente limitada en áreas de gran altitud y latitud debido al estrés por frío durante la siembra, lo que resulta en una pérdida significativa de rendimiento en estas regiones. A pesar de la falta de comprensión de los mecanismos moleculares subyacentes a la germinación a baja temperatura (LTG) en HOAP, descubrir los loci de rasgos cuantitativos (QTL) que confieren este rasgo sin duda beneficiará los esfuerzos de mejoramiento. En el presente estudio, identificamos regiones genómicas y polimorfismos de nucleótido único (SNP) que rigen la tolerancia a la LTG de HOAP en una población F derivada del cruce de YH65 tolerante al frío y FL14 sensible al frío utilizando análisis de segregantes en masa (BSA). El análisis del índice de SNP y la asociación del valor de distancia euclidiana (ED) señalaron la región superpuesta a un intervalo de 2.29 Mb en el cromosoma A05. El intervalo candidato mostró que 122 genes estaban significativamente relacionados con la respuesta al estrés abiótico y la interacción planta-patógeno. Además, se descubrió un sitio de SNP asociado con la tolerancia a la LTG. El sitio de SNP se utilizó como marcador de PCR específico de alelo competitivo (KASP) y se validó en un panel universal de cacahuate. Estos hallazgos pueden proporcionar una valiosa visión de los mecanismos moleculares que sustentan la tolerancia a la LTG y facilitar la crianza selectiva asistida por marcadores en HOAP.