Se aplicaron bolsas de musgo para estudiar el efecto de la contaminación en tres cuerpos de agua en Bulgaria (embalses de Kardzhali, Studen Kladenets y Zhrebchevo), los dos primeros con contaminación industrial antigua y el último contaminado con parafinas cloradas de cadena corta (SCCPs). Musgo Hedw. recolectado de un sitio de fondo (no contaminado) se colocó en jaulas durante un período de 30 días. El presente estudio examinó si la contaminación inorgánica y orgánica detectada con bolsas de musgo resultó en diferencias correspondientes en marcadores moleculares, químicos y micromorfológicos. Se evaluó la expresión suprimida de la subunidad grande de la ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa (rbcL) en las bolsas de musgo de dos de los embalses, contaminados con metales pesados. Hubo una disminución del contenido fenólico total (TPC) en las bolsas de musgo, lo que proporciona una base para estudios adicionales del contenido químico de los musgos acuáticos. También se mostró una respuesta a través de características micromorfológicas de las hojas. En los tres embalses, se registró un aumento en el número de células de hojas de ramitas.