Como una familia de peroxidasa específica de plantas, la peroxidasa de clase III (PRX) desempeña un papel importante en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de las plantas. En este estudio, se realizó un análisis funcional preliminar. El análisis bioinformático reveló que codifica una proteína de 349 aminoácidos que pertenece a la superfamilia de peroxidasas de plantas, con un dominio transmembrana y localización citoplasmática. La región promotora alberga varios elementos cis-actuantes asociados con respuestas al estrés, señalización hormonal, regulación de la luz y expresión específica de meristemos. Se exploró el patrón de expresión específico de tejidos del gen y sus características en respuesta a diferentes estreses utilizando localización subcelular, PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) y transformación heteróloga. Los resultados mostraron que CqPRX9L1, con una estructura transmembrana, se localizó en el citoplasma, codificando 349 aminoácidos y perteneciendo a la superfamilia de peroxisomas de plantas. La región promotora contiene elementos de respuesta al estrés, elementos de respuesta hormonal, elementos de respuesta a la luz y elementos relacionados con la expresión de meristemos. La expresión fue relativamente más alta en espigas y raíces en la etapa de panícula que en tallos y hojas. Mostró un patrón de expresión dinámico que primero disminuyó y luego aumentó bajo estreses abióticos como 15% PEG 6000, baja temperatura y daño por sal, con diferencias en el tiempo y grado de respuesta. Desempeña un papel importante en la respuesta al estrés abiótico al afectar la actividad de enzimas antioxidantes como la superóxido dismutasa (SOD) y la peroxidasa (POD), así como la síntesis y descomposición de prolina (Pro). También afecta la espigación y floración de las plantas al regular genes clave de floración (como FT y AP1) y vías relacionadas con giberelinas (GA). Los resultados establecen una base para revelar las funciones y mecanismos moleculares del gen.