Aunque la soja y el garbanzo pertenecen a la familia de las leguminosas, el contenido de almidón de sus semillas es muy diferente. Actualmente, muchos estudios se centran en los mecanismos moleculares de la síntesis de almidón dentro de una sola especie. Sin embargo, los genes clave y las relaciones regulatorias responsables de la diferencia en el contenido de almidón de las semillas entre las dos especies siguen siendo desconocidos. Para dilucidar los mecanismos moleculares responsables de la diferencia anterior, se utilizaron aquí análisis de multi-ómica y bioinformática para analizar patrones de expresión génica, redes de interacción proteína-proteína, redes de co-expresión génica-factor de transcripción y relaciones regulatorias de miARN-gen basadas en genes metabólicos de sacarosa y almidón reportados en . Los resultados fueron los siguientes. En primer lugar, siete genes de expresión diferencial de las dos especies en el metabolismo de la síntesis de almidón, incluidos , , , , , , y , y el gen de degradación de almidón en soja y garbanzo, pueden contribuir a las diferencias en el contenido de almidón de sus semillas. Luego, la interacción proteína-proteína entre DPEs y PHS puede facilitar la síntesis de almidón en garbanzo. Finalmente, la regulación positiva de dos genes de degradación de almidón ( y ) y cuatro genes de metabolismo de sacarosa (, , y ) por factores de transcripción puede llevar a un menor contenido de almidón en las semillas de soja. Este estudio dilucida los posibles mecanismos moleculares subyacentes a la diferencia en el contenido de almidón de las semillas entre las dos especies y aborda el problema científico de por qué las semillas de soja tienen un contenido de almidón más bajo que las semillas de garbanzo.