Bioinformática y Análisis de Expresión de los Genes de Quitinasa en Fresa () y Estudio Funcional de
Autores: He, Tiannan; Fan, Jianshuai; Jiao, Gaozhen; Liu, Yuhan; Zhang, Qimeng; Luo, Ning; Ahmad, Bilal; Chen, Qingxi; Wen, Zhifeng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Bioinformática y Análisis de Expresión de los Genes de Quitinasa en Fresa () y Estudio Funcional de
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Quitinasas
Genes
Expresión
Fresa
SA
JA
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Las quitinasas de plantas (EC 3.2.1.14) son proteínas relacionadas con la patogénesis (PR) y se han estudiado bien en muchas especies de plantas. Sin embargo, se sabe poco sobre la organización genómica y la expresión de los genes de quitinasa en las fresas. Aquí, se identificaron 23 genes en el genoma de la fresa y se dividieron en subfamilias GH18 y GH19 basándose en relaciones filogenéticas. Se realizó un análisis bioinformático detallado de los genes, incluyendo propiedades fisicoquímicas, ubicación cromosómica, distribución de exones e intrones, disposición de dominios y localización subcelular. Veintidós genes mostraron regulación positiva después de la infección. Tras la aplicación exógena de SA, se observaron cambios significativos en la expresión. La expresión ectópica de aumentó la resistencia a mediante el control de los genes de las vías de señalización de SA y JA. Se predijo que la ubicación de la proteína FvChi-14 estaba en la pared celular o en la matriz extracelular. Especulamos que está involucrada en la resistencia a enfermedades al regular las vías de señalización de SA y JA. Los hallazgos de este estudio proporcionan una referencia teórica para los estudios funcionales de genes y nuevos candidatos para programas de mejora de resistencia al estrés en fresas.
Descripción
Las quitinasas de plantas (EC 3.2.1.14) son proteínas relacionadas con la patogénesis (PR) y se han estudiado bien en muchas especies de plantas. Sin embargo, se sabe poco sobre la organización genómica y la expresión de los genes de quitinasa en las fresas. Aquí, se identificaron 23 genes en el genoma de la fresa y se dividieron en subfamilias GH18 y GH19 basándose en relaciones filogenéticas. Se realizó un análisis bioinformático detallado de los genes, incluyendo propiedades fisicoquímicas, ubicación cromosómica, distribución de exones e intrones, disposición de dominios y localización subcelular. Veintidós genes mostraron regulación positiva después de la infección. Tras la aplicación exógena de SA, se observaron cambios significativos en la expresión. La expresión ectópica de aumentó la resistencia a mediante el control de los genes de las vías de señalización de SA y JA. Se predijo que la ubicación de la proteína FvChi-14 estaba en la pared celular o en la matriz extracelular. Especulamos que está involucrada en la resistencia a enfermedades al regular las vías de señalización de SA y JA. Los hallazgos de este estudio proporcionan una referencia teórica para los estudios funcionales de genes y nuevos candidatos para programas de mejora de resistencia al estrés en fresas.