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Bioinformática y Análisis de Expresión de los Genes de Quitinasa en Fresa () y Estudio Funcional de

Autores: He, Tiannan; Fan, Jianshuai; Jiao, Gaozhen; Liu, Yuhan; Zhang, Qimeng; Luo, Ning; Ahmad, Bilal; Chen, Qingxi; Wen, Zhifeng

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Bioinformática y Análisis de Expresión de los Genes de Quitinasa en Fresa () y Estudio Funcional de


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Quitinasas
Genes
Expresión
Fresa
SA
JA

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 12

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las quitinasas de plantas (EC 3.2.1.14) son proteínas relacionadas con la patogénesis (PR) y se han estudiado bien en muchas especies de plantas. Sin embargo, se sabe poco sobre la organización genómica y la expresión de los genes de quitinasa en las fresas. Aquí, se identificaron 23 genes en el genoma de la fresa y se dividieron en subfamilias GH18 y GH19 basándose en relaciones filogenéticas. Se realizó un análisis bioinformático detallado de los genes, incluyendo propiedades fisicoquímicas, ubicación cromosómica, distribución de exones e intrones, disposición de dominios y localización subcelular. Veintidós genes mostraron regulación positiva después de la infección. Tras la aplicación exógena de SA, se observaron cambios significativos en la expresión. La expresión ectópica de aumentó la resistencia a mediante el control de los genes de las vías de señalización de SA y JA. Se predijo que la ubicación de la proteína FvChi-14 estaba en la pared celular o en la matriz extracelular. Especulamos que está involucrada en la resistencia a enfermedades al regular las vías de señalización de SA y JA. Los hallazgos de este estudio proporcionan una referencia teórica para los estudios funcionales de genes y nuevos candidatos para programas de mejora de resistencia al estrés en fresas.

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