La isomerasa de chalcona (CHI) no solo es una enzima relacionada con la biosíntesis de flavonoides, sino también una de las enzimas clave en la vía metabólica de los flavonoides. En este estudio, se identificaron miembros de la familia de genes CHI en el genoma completo de la batata. Se utilizaron métodos bioinformáticos para analizar las propiedades físico-químicas, la evolución sistemática, el dominio conservado, la ubicación cromosómica, los elementos cis-actuantes del promotor, entre otros, de los miembros de la familia de genes CHI. Además, se analizó la expresión específica del sitio tisular de los miembros de la familia de genes CHI y sus patrones de expresión bajo tres tipos de estrés abiótico. Los resultados mostraron que se identificaron cinco miembros de la familia de genes IbCHI en la batata, que estaban distribuidos de manera desigual en cuatro cromosomas. La estructura secundaria y terciaria de la proteína eran consistentes, y había un dominio conservado relacionado con la isomerasa de chalcona. La predicción de la localización subcelular mostró que se localizaba principalmente en el citoplasma y en los cloroplastos. La evolución sistemática mostró que los miembros de la familia de genes CHI de la batata podían dividirse en Tipo I-IV, y el gen Tipo I mostró actividad catalítica de CHI en callos transgénicos. Se identificaron pares de genes colineales entre la batata y especies afines. Su promotor contiene elementos de respuesta a la luz, elementos de respuesta hormonal y elementos de respuesta al estrés. Los resultados del análisis de PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) mostraron que la expresión del gen IbCHI era específica del tejido y que los genes catalíticos sirven como principales respondedores al estrés abiótico, mientras que los miembros no catalíticos pueden ajustar el flujo metabólico o participar en la señalización del estrés por bajas temperaturas, sal y sequía. Este estudio puede proporcionar una base teórica para un estudio de genómica funcional de seguimiento de la familia de genes de isomerasa de chalcona en la batata.