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Análisis bioinformático de la familia de genes BTB y caracterización funcional en respuesta a estrés abiótico y biótico

Autores: Zhu, Peipei; Fan, Yujie; Xu, Pingluo; Fan, Guoqiang

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Análisis bioinformático de la familia de genes BTB y caracterización funcional en respuesta a estrés abiótico y biótico


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Estructura genética
Evolución filogenética
Función
Estrés biótico
Estrés abiótico
Datos de transcriptoma

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Para aprender sobre la estructura genética, la evolución filogenética y la función bajo estrés biótico y abiótico de los genes BTB (Bric-a-Brac/Tramtrack/Broad Complex) en , se llevó a cabo una evaluación de la secuencia del genoma completo, y se identificaron un total de 62 genes. El análisis filogenético mostró que las proteínas PfBTB se dividen en ocho grupos, y estas proteínas son altamente conservadas. Los genes estaban distribuidos de manera desigual en 17 cromosomas. El análisis de colinealidad encontró que la replicación de fragmentos y la replicación en tándem son los principales modos de amplificación de genes en la familia. El análisis de elementos de acción sugiere que los genes pueden estar involucrados en una variedad de procesos biológicos. Los resultados del análisis transcriptómico mostraron que respondieron al muérdago de Paulownia (PaWB), mientras que respondieron al estrés por sequía, y los resultados de RT-qPCR respaldan aún más la fiabilidad de los datos del transcriptoma. Además, el análisis de asociación entre miARN y transcriptoma reveló una relación de 91 pares de objetivos entre miARN y . En conclusión, los genes en son identificados sistemáticamente en esta investigación. Este trabajo proporciona conocimientos útiles para apreciar más plenamente las funciones potenciales de estos genes y sus posibles roles en la aparición de PaWB y en respuesta al estrés.

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