Investigar los factores que apoyan la riqueza de especies (S) en contextos insulares puede proporcionar información para la conservación de la biodiversidad insular. Nuestro objetivo fue desacoplar el efecto de los factores (área de la isla, distancia desde el continente y diversidad de hábitats) considerados en tres hipótesis o una combinación de ellas para explicar S en siete islas del Archipiélago Toscano: Área (relación especie-área, SAR), área y distancia desde el continente (hipótesis de equilibrio, EQH) y hábitat (hipótesis de diversidad de hábitats, HDH). Utilizamos conjuntos de datos publicados y originales para evaluar S (excepto especies exóticas) para 42 taxones (14 taxones animales y 28 taxones de plantas) en cada isla, y utilizamos S como la variable dependiente y los factores como covariables en modelos de regresión. En 31 taxones, los datos apoyaron una de las hipótesis probadas o una combinación de ellas, siendo las hipótesis más comúnmente apoyadas SAR (12 taxones) y EQH (10 taxones). El efecto del área también fue evidente en SAR + HDH (cinco taxones) y EQH + HDH (un taxón), convirtiéndose en el factor predominante para explicar S. Dado que las distancias son relativamente cortas, y tres de cada cuatro islas son islas de puente terrestre, el efecto de la distancia fue significativo para 12 taxones. Los efectos de la diversidad de hábitats fueron evidentes solo para nueve taxones. El enfoque multi-taxón nos permitió entender el efecto diferencial de los factores entre taxones en la influencia de S en un solo archipiélago. Además, el enfoque de rango multi-taxonómico destacó cómo la información contenida en rangos taxonómicos superiores (por ejemplo, División) puede ser sustancialmente diferente de la derivada de rangos inferiores (por ejemplo, Familia). Estas ideas son de particular importancia desde una perspectiva de conservación de la biodiversidad del archipiélago, y este enfoque puede ser transferido a sistemas fragmentados en el continente.