El mar de Barents es una de las regiones árticas que está cambiando más rápidamente, con un descenso sin precedentes del hielo marino y un aumento en la temperatura y salinidad del agua. Hemos estudiado la diversidad de comunidades procariotas utilizando metabarcoding 16S en las partes occidental y noreste del mar de Barents a lo largo de la sección de Kola y la sección desde Novaya Zemlya hasta la tierra de Franz José. El método de agrupamiento independiente de hipótesis reveló la existencia de dos tipos distintos de comunidades. Los taxones procariotas más comunes se compartieron entre los dos tipos de comunidades, pero su abundancia relativa era diferente. Se encontró que la ubicación geográfica de los sitios de muestreo explicaba más del 30% de la diferencia entre comunidades, mientras que no se encontró una correlación estadísticamente significativa entre los parámetros ambientales y la composición de la comunidad. Los representantes de los géneros y fueron dominantes en las muestras de ambos tipos de comunidades. El primer tipo de comunidad también estaba dominado por miembros de y un representante no clasificado de la familia. El segundo tipo de comunidad también tenía una proporción significativa de representantes de SAR92, SAR11 Clade I, NS9 y SUP05. El origen de estas comunidades puede explicarse por la influencia de factores ambientales o por los diferentes orígenes de las masas de agua. Esta investigación destaca la importancia de estudiar los patrones biogeográficos en el mar de Barents en comparación con los de las comunidades procariotas del Atlántico Norte y el océano Ártico.