El cloruro de didecil dimetilamonio (DDAC) y la guanidina polihexametileno (PHMG) exhiben alta actividad antimicrobiana y se utilizan ampliamente como agentes biocidas en aditivos para inodoros químicos para la gestión de lodos fecales (FS). La eliminación de FS tratados con biocidas en una planta de tratamiento de aguas residuales (WWTP) es un gran problema ambiental. Es posible reducir el daño ambiental mediante el uso de agentes biocidas que se descomponen fácilmente después de realizar sus funciones biocidas principales. En este trabajo, se propone utilizar el hecho de un aumento gradual del pH de FS desde el 7.5 inicial hasta 9.0-10.0 debido a la descomposición de la urea. Se seleccionaron seis compuestos biocidas que son capaces de degradarse rápidamente en un ambiente alcalino y uno que se degrada naturalmente tras una incubación prolongada. Cuatro de ellos: bronopol (30 mg/L), DBNPA (500 mg/L), Sharomix (500 mg/L) y percarbonato de sodio (6000 mg/L) han mostrado ser prometedores para la gestión ambientalmente amigable de FS. En la dosis seleccionada, redujeron con éxito la actividad microbiana tanto en condiciones aeróbicas como anaeróbicas y son rentables. Después de 10 días de incubación, se produjo la degradación del biocida medida por la demanda biológica de oxígeno (DBO) en FS tratados con biocidas. Tales FS pueden ser descargados a la WWTP sin causar daños severos al proceso de lodo activado, sin necesidad de dilución y procedimientos adicionales para neutralizar la toxicidad.