El riego intensivo junto con la entrada excesiva de fertilizantes de nitrógeno (N) ha resultado en altas emisiones de gases de efecto invernadero (GEI) en sistemas de cultivo de vegetales. El biochar como enmienda del suelo ha sido promovido como una opción deseable para reducir las emisiones de GEI en sistemas agrícolas, pero sus efectos interactivos con la disponibilidad de N en el suelo en sistemas de vegetales aún no han sido aclarados. Realizamos un estudio de campo para examinar cómo interactúa el biochar con el fertilizante N en la emisión anual de metano (CH) y óxido nitroso (NO) en un sistema de cultivo de vegetales en invernadero intensamente regado, actuando como fuentes de CH y NO atmosféricos en China subtropical. La enmienda de biochar aumentó significativamente las emisiones de CH en un 33% y 85%, mientras que disminuyó las emisiones de NO en un 22% y 12% con y sin la entrada de fertilizante N, respectivamente. La combinación de N del fertilizante debilitó la respuesta positiva de CH al biochar, mientras que mejoró el potencial de mitigación del biochar para el NO. Los factores de emisión directa anuales de N del fertilizante para el NO se estimaron en un 1,35% y 1,94% para los campos con y sin enmienda de biochar, respectivamente. El potencial de calentamiento global sostenido anual (SGWP) y la intensidad de gases de efecto invernadero (GHGI) disminuyeron significativamente con la enmienda de biochar, y este efecto de mitigación se vio potenciado con la combinación de N del fertilizante. En conjunto, resaltamos que el biochar puede conciliar un mayor rendimiento y un menor impacto climático en sistemas intensivos de cultivo de vegetales en invernadero en China subtropical, especialmente en suelos de vegetales con alta disponibilidad de N.