El monooxigenasa que contiene flavina de la cepa SK1 (FMO) es un biocatalizador valioso para la preparación de sulfoxidos ópticamente activos, entre otros compuestos valiosos. En este estudio, exploramos los beneficios de utilizar Solventes Naturales de Eutécticos Profundos (NADESs) al realizar la oxidación con este biocatalizador, fusionado con la fosfito deshidrogenasa para la regeneración de cofactores (PTDH-FMO). Se encontró que los sulfoxidos ópticamente activos podían obtenerse con conversiones ligeramente más altas en un 10% de NADES al trabajar con concentraciones de sustrato de 50-200 mM, mientras que no hubo pérdida en la enantioselectividad. Con estos resultados, se demuestra por primera vez que las monooxigenasas que contienen flavina pueden ser empleadas como biocatalizadores en presencia de NADESs.