El transporte es un factor de estrés que puede causar desequilibrios fisiológicos y metabólicos en el ganado, resultando en hipertermia inducida por estrés. En los búfalos de agua, los estudios sobre el estado térmico de los animales durante la movilización son escasos. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo comparar la respuesta térmica de 1516 búfalos de agua utilizando termografía infrarroja (IRT) durante 15 viajes cortos (783 animales, 60,291 registros, duración promedio = 50.33 min +/- 5.48 min) y 14 viajes largos (733 animales, 56,441 registros, duración promedio = 13.31 h +/- 47.32 min). La temperatura superficial se evaluó en 11 regiones (periocular, carúncula lagrimal, nasal, párpado inferior, auricular, frontal-parietal, miembro pélvico, torso, abdominal, lumbar y torácica) durante siete fases desde el pastoreo hasta el post-transporte. Se encontró que la temperatura superficial de las regiones periocular, carúncula lagrimal, nasal, auricular, frontal-parietal, miembro pélvico, torso, abdominal, lumbar y torácica fue significativamente más alta durante los viajes cortos (+3 grados C) en comparación con los viajes largos (< 0.0001). En particular, la región frontal-parietal tuvo un aumento significativo de 10 grados C durante la fase post-transporte (< 0.0001) en ambos grupos, registrando las temperaturas más altas durante esta fase. Asimismo, se encontró una fuerte correlación positiva significativa entre las diferentes regiones (r = 0.90, < 0.0001). Cabe mencionar que las fases de pastoreo, carga, pre- y post-transporte fueron las que registraron la mayor respuesta térmica, posiblemente debido a la influencia de la interacción humana. Finalmente, se encontró una fuerte correlación positiva (r por encima de 0.9, > 0.001) entre las regiones periocular, carúncula lagrimal, pabellón auricular y miembro pélvico. Según los resultados, los viajes cortos podrían considerarse un evento estresante que dificulta la generación térmica, a diferencia de los viajes largos.