subsp. Cepa TE5: Un prometedor bacterium de control biológico contra el agente causal de la mancha en el trigo
Autores: Campos-Avelar, Ixchel; García Jaime, Michelle Fabiela; Morales Sandoval, Pamela Helué; Parra-Cota, Fannie Isela; de los Santos Villalobos, Sergio
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
subsp. Cepa TE5: Un prometedor bacterium de control biológico contra el agente causal de la mancha en el trigo
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Cepa
TE5
Agente de control biológico
Secuenciación del genoma
Metabolitos de biocontrol
Actividad antifúngica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La cepa TE5 fue aislada de la rizosfera de trigo (L. subsp.) cultivada en un campo comercial de trigo en el Valle Yaqui en México. En este trabajo, presentamos la cepa TE5 como un prometedor agente de control biológico contra. Primero, después de su secuenciación genómica a través de Illumina NovaSeq, esta cepa mostró un tamaño de genoma de 4,262,927 pb, con un contenido de G + C del 43.74%, un valor de N50 de 397,059 pb, un valor de L50 de 4 pb y 41 contigs (>500 pb). La afiliación taxonómica se llevó a cabo utilizando índices de relación genómica general (OGRIs) y la construcción de un árbol filogenómico basado en el genoma completo. Los resultados indicaron que la cepa TE5 se identifica con subsp. La anotación genómica utilizando Rapid Annotation Using Subsystems Technology (RAST) y Rapid Prokaryotic Genome Annotation (Prokka) indicó la presencia de 4615 secuencias de ADN codificantes (CDSs) distribuidas en 330 subsistemas, que incluían familias de genes asociadas con el control biológico, la respuesta al estrés y la competencia por el hierro. Además, cuando se utilizó la plataforma antiSMASH 7.1 para la minería del genoma, los resultados indicaron la presencia de siete clústeres de genes biosintéticos putativos relacionados con la producción de metabolitos de control biológico, a saber, subtilosina A, bacilibactina, fengicina, bacilaeno, bacilisina, surfactina y rizotictina A. Además, se evaluó la actividad antifúngica de la cepa TE5 y su extracto celular libre (CFE) contra, un patógeno emergente del trigo. Los resultados de la confrontación dual in vitro mostraron una inhibición del crecimiento fúngico del 67% por la cepa TE5. Adicionalmente, su CFE inhibió casi completamente (93%) el crecimiento del hongo fitopatógeno estudiado en medios líquidos. Observaciones adicionales del impacto de estos metabolitos bacterianos en la germinación de esporas fúngicas exhibieron inhibición de esporas fúngicas a través de la degradación de la hifa germinativa, evitando el desarrollo del micelio. Finalmente, se evaluó el efecto protector de la cepa TE5 contra para plántulas de trigo. Los resultados mostraron una disminución significativa (83%) en la severidad de la enfermedad en comparación con la infección de la planta sin inoculación del agente de control biológico. Así, este trabajo propone la cepa TE5 como un prometedor agente de control biológico contra el patógeno del trigo, sugiriendo además que los lipopeptidos son el modo de acción potencial, junto con la estimulación del crecimiento y defensa de las plantas.
Descripción
La cepa TE5 fue aislada de la rizosfera de trigo (L. subsp.) cultivada en un campo comercial de trigo en el Valle Yaqui en México. En este trabajo, presentamos la cepa TE5 como un prometedor agente de control biológico contra. Primero, después de su secuenciación genómica a través de Illumina NovaSeq, esta cepa mostró un tamaño de genoma de 4,262,927 pb, con un contenido de G + C del 43.74%, un valor de N50 de 397,059 pb, un valor de L50 de 4 pb y 41 contigs (>500 pb). La afiliación taxonómica se llevó a cabo utilizando índices de relación genómica general (OGRIs) y la construcción de un árbol filogenómico basado en el genoma completo. Los resultados indicaron que la cepa TE5 se identifica con subsp. La anotación genómica utilizando Rapid Annotation Using Subsystems Technology (RAST) y Rapid Prokaryotic Genome Annotation (Prokka) indicó la presencia de 4615 secuencias de ADN codificantes (CDSs) distribuidas en 330 subsistemas, que incluían familias de genes asociadas con el control biológico, la respuesta al estrés y la competencia por el hierro. Además, cuando se utilizó la plataforma antiSMASH 7.1 para la minería del genoma, los resultados indicaron la presencia de siete clústeres de genes biosintéticos putativos relacionados con la producción de metabolitos de control biológico, a saber, subtilosina A, bacilibactina, fengicina, bacilaeno, bacilisina, surfactina y rizotictina A. Además, se evaluó la actividad antifúngica de la cepa TE5 y su extracto celular libre (CFE) contra, un patógeno emergente del trigo. Los resultados de la confrontación dual in vitro mostraron una inhibición del crecimiento fúngico del 67% por la cepa TE5. Adicionalmente, su CFE inhibió casi completamente (93%) el crecimiento del hongo fitopatógeno estudiado en medios líquidos. Observaciones adicionales del impacto de estos metabolitos bacterianos en la germinación de esporas fúngicas exhibieron inhibición de esporas fúngicas a través de la degradación de la hifa germinativa, evitando el desarrollo del micelio. Finalmente, se evaluó el efecto protector de la cepa TE5 contra para plántulas de trigo. Los resultados mostraron una disminución significativa (83%) en la severidad de la enfermedad en comparación con la infección de la planta sin inoculación del agente de control biológico. Así, este trabajo propone la cepa TE5 como un prometedor agente de control biológico contra el patógeno del trigo, sugiriendo además que los lipopeptidos son el modo de acción potencial, junto con la estimulación del crecimiento y defensa de las plantas.