Este estudio investigó los aislamientos bacterianos recuperados de truchas marrones durante eventos de mortalidad en cinco granjas de acuicultura en España: dos de las granjas habían utilizado antibióticos recientemente, mientras que tres no habían aplicado ningún tratamiento en los seis meses previos a la toma de muestras. Se recolectaron muestras de tejido de peces moribundos que mostraban signos clínicos como lesiones en la piel y hemorragias durante los brotes en 2022 y 2023. La identificación bacteriana se realizó utilizando PCR en tiempo real, amplificación y secuenciación del gen 16S rRNA y el espaciador intergénico ITS-1, y espectrometría de masas MALDI-TOF. Se identificaron un total de 19 aislamientos, siendo las bacterias Gram-negativas, particularmente spp., las más frecuentemente recuperadas. Algunos aislamientos pertenecían a géneros no tradicionalmente asociados con enfermedades en peces, lo que resalta la necesidad de una mayor investigación sobre su papel en la salud de los peces. Se detectaron cepas resistentes a antibióticos en cuatro de las cinco granjas, incluidas aquellas sin uso reciente de antibióticos, lo que sugiere una posible contribución de factores ambientales y antropogénicos a la propagación de la resistencia. No se detectaron bacterias resistentes a florfenicol, lo que indica su continua efectividad. En general, los hallazgos subrayan la importancia de las medidas de salud preventiva, el uso prudente de antibióticos y el monitoreo ambiental en la acuicultura de trucha marrón. Los resultados apoyan una perspectiva de Una Salud al vincular las prácticas de cultivo de peces, la calidad ambiental y las consideraciones de salud pública.