Las plantas son una fuente importante de compuestos bioactivos esenciales que no solo tienen un papel beneficioso en la salud y nutrición humana, sino que también actúan como impulsores en la formación del microbioma intestinal. Sin embargo, el mecanismo de sus atributos funcionales no se comprende completamente a pesar de su importancia. Una planta importante es el azafrán, que posee enormes aplicaciones medicinales, nutricionales e industriales como alimentos y cosméticos. La importancia de esta planta se atribuye en gran medida a sus increíbles constituyentes bioactivos como los crocinas, crocetina, safranal, picocrocina y glucósidos. Estos compuestos bioactivos poseen una amplia gama de actividades terapéuticas contra múltiples enfermedades humanas. Dado que un gran número de estudios ha revelado efectos secundarios negativos no deseados de los medicamentos modernos, las comunidades científicas a nivel global están investigando un gran número de plantas medicinales para explorar productos naturales como las mejores alternativas. Teniendo en cuenta esto, los hallazgos de investigación disponibles indican que el azafrán tiene un gran potencial para ser explorado más a fondo y establecer medicamentos alternativos basados en productos naturales para beneficios en la salud. En esta revisión, proporcionamos una actualización sobre el papel de los compuestos bioactivos del azafrán como agentes terapéuticos (trastornos humanos y actividad antimicrobiana) y sus valores nutricionales. También destacamos el papel de las herramientas ómicas y de ingeniería metabólica para aumentar el contenido de moléculas bioactivas clave del azafrán para su producción masiva. Finalmente, los estudios preclínicos y clínicos parecen ser necesarios para establecer su potencial terapéutico contra enfermedades humanas.