Para adaptarse al estilo de vida actual, hay una gran demanda y mercado para los alimentos procesados cuya fabricación requiere múltiples pasos. La creciente demanda aumenta la presión sobre los productores y los organismos reguladores para proporcionar métodos sensibles, fáciles y rentables que protejan la salud de los consumidores. En el proceso de múltiples pasos de la transformación de alimentos, hay varias oportunidades para que los microbios o contaminantes que causan el deterioro de los alimentos entren en la cadena de suministro. En este contexto, hay una necesidad urgente de comprender, implementar y monitorear los niveles de contaminantes utilizando diversos métodos disponibles, como sistemas microfluídicos de gota de célula única, biosensores de ADN, nanobiosensores, biosensores basados en teléfonos inteligentes, aptasensores y métodos basados en microarreglos de ADN. La revisión actual se centra en los avances en estos métodos para la detección de contaminantes y patógenos transmitidos por los alimentos.