La mejora de la soja ha entrado en una nueva era con la llegada de estrategias multi-ómicas e innovaciones en bioinformática, lo que permite prácticas de cría más precisas y eficientes. Esta revisión integral examina la aplicación de enfoques multi-ómicos en la soja, abarcando genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica, epigenómica y fenómica. Primero exploramos la pre-cría y la selección genómica como herramientas que han sentado las bases para la mejora avanzada de rasgos. Posteriormente, profundizamos en las contribuciones específicas de cada campo -ómico, destacando cómo las herramientas y recursos de bioinformática han facilitado la generación e integración de datos multifacéticos. La revisión enfatiza el poder de integrar conjuntos de datos multi-ómicos para elucidar rasgos complejos y impulsar el desarrollo de cultivares de soja superiores. Se discuten tendencias emergentes, incluidas técnicas computacionales novedosas y tecnologías de alto rendimiento, en el contexto de su potencial para revolucionar la cría de soja. Finalmente, abordamos los desafíos asociados con la integración multi-ómica y proponemos direcciones futuras para superar estos obstáculos, con el objetivo de acelerar el ritmo de mejora de la soja. Esta revisión sirve como un recurso crucial para investigadores y criadores que buscan aprovechar estrategias multi-ómicas para mejorar la productividad y resiliencia de la soja.