El crecimiento gravitropismo de las raíces es crucial para que las plantas se adapten a los entornos terrestres y adquieran nutrientes del suelo. Los tomates son un cultivo económico vital que requiere abundante agua y nutrientes para su crecimiento y desarrollo. Sin embargo, hay pocos informes sobre los mecanismos regulatorios del gravitropismo de las raíces de tomate, particularmente el crecimiento gravitropismo de las raíces mediado por auxina. Aquí, revelamos la vía de señalización de la auxina que regula la respuesta gravitacional de las raíces de tomate a través de tratamiento con auxina exógena e inhibidores de auxina combinados con perfilado de transcriptoma. Nuestros datos subrayan la necesidad de biosíntesis de auxina, transporte y niveles óptimos para el crecimiento gravitropismo de las raíces de tomate. El tratamiento con auxina exógena o inhibidores de biosíntesis de auxina disminuyó la respuesta gravitropismo en las raíces de tomate. Por el contrario, el tratamiento con un inhibidor de transporte de auxina condujo a una respuesta agravitropismo robusta. Además, observamos que la auxina controla el crecimiento gravitropismo de las raíces al establecer gradientes de concentración e influye en la percepción de las señales de gravedad por parte de las raíces al regular positivamente la acumulación de gránulos de almidón. El tratamiento con la auxina exógena NAA aumentó la síntesis de almidón, mientras que la aplicación exógena del inhibidor de biosíntesis de auxina yucasina redujo la síntesis de almidón en las raíces de tomate. Nuestro estudio observó una respuesta gravitropismo lenta en las raíces de tomate cherry cultivadas (Aisheng). El análisis de series temporales mostró que las raíces de tomate se doblan hacia la gravedad a un ritmo más lento. El análisis de transcriptoma reveló que se identificaron muchos (2770) genes expresados diferencialmente (DEGs) en las raíces después de 36 h de estimulación gravitacional. En contraste, solo se detectaron 58 DEGs después de 3 h de estimulación gravitacional, lo que apoya aún más el fenotipo de respuesta gravitropismo lenta de las raíces de tomate. El análisis de GO y KEGG destacó la respuesta a la auxina, el metabolismo de almidón y azúcar, y la modificación de la pared celular como las principales vías regulatorias involucradas en la respuesta gravitropismo y el crecimiento de las raíces de tomate. Nuestros resultados indican que la auxina media la percepción de las señales de gravedad por parte de las raíces a través de la regulación de retroalimentación de la acumulación de almidón y controla la curvatura gravitropismo de las raíces regulando la expresión de genes relacionados con la modificación de la pared celular.