El hipotiroidismo es una condición en la que la glándula tiroides del paciente no puede producir suficientes hormonas tiroideas (principalmente triyodotironina y tiroxina). La causa principal del hipotiroidismo es la destrucción mediada por autoinmunidad de la glándula tiroides, conocida como tiroiditis de Hashimoto. La concentración deseada de hormona tiroidea de un paciente se logra mediante la administración oral de hormona tiroidea, generalmente levotiroxina. Establecer dosis individuales de levotiroxina para lograr concentraciones deseadas de hormona tiroidea requiere varias visitas del paciente. Además, falta una guía clara para el régimen de dosificación y existen diferencias significativas entre individuos. Este estudio tiene como objetivo diseñar un algoritmo de dosificación automática digital para pacientes que sufren de tiroiditis de Hashimoto. El comportamiento dinámico de la función tiroidea relevante se modela matemáticamente. Se explotan métodos de control automático para el diseño del propuesto algoritmo de dosificación robusto basado en el modelo de levotiroxina. Se realizan simulaciones numéricas para evaluar el modelo matemático y el algoritmo de dosificación. Con la ayuda del controlador desarrollado, las concentraciones de hormonas tiroideas de los pacientes, emuladas utilizando Thyrosim, han sido reguladas en el estado eutiroideo. El concepto propuesto demuestra respuestas confiables ante parámetros de pacientes variables. Nuestro modelo desarrollado proporciona una base útil para el diseño de algoritmos automáticos de dosificación de levotiroxina. El bucle de retroalimentación robusto propuesto contribuye a los primeros resultados para algoritmos de dosificación de tiroides asistidos por computadora.