f. sp. es considerada la enfermedad más destructiva para la lenteja (Medik.) en todo el mundo. A pesar de los extensos estudios que elucidan la respuesta metabólica de las plantas a los agentes fúngicos, existe una brecha de conocimiento en los mecanismos bioquímicos que rigen la resistencia en la lenteja. Este estudio tuvo como objetivo evaluar comparativamente la respuesta metabólica de dos genotipos de lenteja, con fenotipos contrastantes para la resistencia, a la inoculación. Además de obtener información sobre la reprogramación metabólica en respuesta a la inoculación, el estudio se centró en descubrir nuevos biomarcadores para mejorar la selección temprana de resistencia. Se empleó un perfilado metabólico mediado por GC-MS de hojas y raíces para monitorear los cambios entre genotipos y tratamientos, así como su interacción. En total, el análisis arrojó 178 compuestos cuantificables, de los cuales la gran mayoría pertenecía a los grupos de carbohidratos, aminoácidos, polioles y ácidos orgánicos. A pesar de la magnitud de las fluctuaciones metabólicas en respuesta a la inoculación en ambos genotipos estudiados, se notaron alteraciones significativas en el contenido de 18 compuestos, de los cuales 10 y 8 compuestos se referían a raíces y brotes, respectivamente. Los datos generales subrayan la contribución crucial del palatinol y la L-prolina en la respuesta metabólica de raíces y brotes, respectivamente, ofreciendo así posibilidades para su explotación como biomarcadores metabólicos para la resistencia en la lenteja. Hasta donde sabemos, este es el primer enfoque basado en metabolómica para desentrañar los efectos de la inoculación en el metaboloma de la lenteja, proporcionando así información crucial relacionada con aspectos clave de la interacción lenteja-. Las futuras investigaciones en aspectos metabólicos de las interacciones lenteja- sin duda revolucionarán la búsqueda de metabolitos subyacentes a la resistencia, allanando así el camino hacia la mejora de los esfuerzos de cría para combatir la marchitez por fusarium en la lenteja.