Asociación genómica a nivel de genoma y predicción genómica para el color de las papas fritas
Autores: Byrne, Stephen; Meade, Fergus; Mesiti, Francesca; Griffin, Denis; Kennedy, Colum; Milbourne, Dan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Asociación genómica a nivel de genoma y predicción genómica para el color de las papas fritas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Patatas
Almacenamiento
Glucosa
Acrilamida
Brotación
Genómica
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
Las papas destinadas para freír normalmente se almacenan por encima de los 8 grados; por debajo de esta temperatura, se acumula glucosa, lo que lleva a colores de fritura muy oscuros y a la acumulación potencial de acrilamida. Desafortunadamente, la brotación ocurre por encima de los 4 grados e impacta la calidad del producto, lo que hace necesario el uso de productos químicos supresores de brotes. Por lo tanto, un objetivo de los criadores es desarrollar papas con un excelente color de fritura, que se mantenga durante el almacenamiento por debajo de los 8 grados. La selección genómica o asistida por marcadores ofrece una oportunidad para mejorar la eficiencia de la cría de papas y así ayudar a los criadores a alcanzar este objetivo. En este estudio, hemos acumulado datos de color de fritura en una gran población de líneas de papas y los hemos combinado con datos genotípicos para llevar a cabo un GWAS y evaluar la precisión de la predicción genómica. Fuimos capaces de identificar un importante QTL en el cromosoma 10 para el color de fritura, y predecir el color de fritura con una precisión moderada usando marcadores en todo el genoma. Además, nuestros resultados proporcionan evidencia de que es posible identificar un pequeño subconjunto de SNPs para características de procesamiento que pueden ofrecer una capacidad predictiva moderada, aunque menor que la lograda con marcadores en todo el genoma.
Descripción
Las papas destinadas para freír normalmente se almacenan por encima de los 8 grados; por debajo de esta temperatura, se acumula glucosa, lo que lleva a colores de fritura muy oscuros y a la acumulación potencial de acrilamida. Desafortunadamente, la brotación ocurre por encima de los 4 grados e impacta la calidad del producto, lo que hace necesario el uso de productos químicos supresores de brotes. Por lo tanto, un objetivo de los criadores es desarrollar papas con un excelente color de fritura, que se mantenga durante el almacenamiento por debajo de los 8 grados. La selección genómica o asistida por marcadores ofrece una oportunidad para mejorar la eficiencia de la cría de papas y así ayudar a los criadores a alcanzar este objetivo. En este estudio, hemos acumulado datos de color de fritura en una gran población de líneas de papas y los hemos combinado con datos genotípicos para llevar a cabo un GWAS y evaluar la precisión de la predicción genómica. Fuimos capaces de identificar un importante QTL en el cromosoma 10 para el color de fritura, y predecir el color de fritura con una precisión moderada usando marcadores en todo el genoma. Además, nuestros resultados proporcionan evidencia de que es posible identificar un pequeño subconjunto de SNPs para características de procesamiento que pueden ofrecer una capacidad predictiva moderada, aunque menor que la lograda con marcadores en todo el genoma.