La obesidad es una importante preocupación de salud pública tanto en humanos como en animales, lo que lleva a varias complicaciones metabólicas. Estudios recientes en humanos han clasificado la obesidad en dos fenotipos, obesidad metabólicamente saludable (MHO) y obesidad metabólicamente no saludable (MUO), basándose en factores de riesgo cardiovascular y metabólico. Los casos de MHO carecen de estos factores de riesgo y están protegidos de las complicaciones metabólicas de la obesidad, mientras que los casos de MUO presentan las características opuestas. Además, estudios recientes han destacado el posible papel del microbioma intestinal en la determinación de la salud metabólica de los individuos obesos. Sin embargo, los estudios sobre la asociación entre el microbioma intestinal y la obesidad y las anomalías metabólicas en gatos son limitados. Por lo tanto, nuestro objetivo fue examinar la asociación entre los fenotipos de salud metabólica y la composición y diversidad del microbiota intestinal en gatos obesos. Investigamos parámetros hormonales y de bioquímica sérica y la composición del microbiota intestinal en grupos no obesos (NO), MHO y MUO. Las abundancias de y fueron significativamente más altas en el grupo obeso en comparación con el grupo NO, mostrando una correlación positiva con el índice de masa corporal. La abundancia de fue significativamente mayor en el grupo MUO en comparación con el grupo NO, mostrando una correlación positiva con los niveles de triglicéridos y colesterol total. Sin embargo, la obesidad, ya sea MHO o MUO, tuvo solo un impacto mínimo en el microbiota fecal. Por lo tanto, se justifican más estudios para investigar si el microbiota intestinal podría ser una herramienta beneficiosa para el tratamiento o manejo de esta condición.