Las malas hierbas que infestan los cultivos son un factor principal que limita la productividad agrícola en todo el mundo. El arroz silvestre, también llamado arroz rojo, ha experimentado eventos evolutivos independientes a través del flujo genético de parientes de arroz silvestre y la desdomesticación del arroz cultivado. Cada evento evolutivo dotó al arroz silvestre de habilidades competitivas que le permitieron prosperar junto al arroz cultivado y reducir drásticamente los rendimientos en los campos de arroz. Comprender cómo evoluciona la competitividad es importante no solo para el manejo de malas hierbas agrícolas nocivas, sino también para la transferencia de rasgos del arroz silvestre al arroz cultivado. Estudios moleculares del arroz silvestre utilizando repeticiones de secuencia simple (SSR), polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP) y secuenciación de genoma completo han mostrado grandes variaciones genéticas en poblaciones de arroz silvestre a nivel mundial. Estas variaciones son evidentes tanto a nivel de genoma completo como a nivel de alelo único, incluyendo (desprendimiento), (emergencia y floración) y (pigmentación del pericarpio). El objetivo de esta revisión es describir la diversidad genética del germoplasma actual de arroz silvestre y la importancia del germoplasma de arroz silvestre como una nueva fuente de resistencia a enfermedades. Comprender estas variaciones, especialmente a nivel alélico, también es crucial, ya que los loci individuales que controlan rasgos importantes pueden ser un gran objetivo para los mejoradores de arroz.