El cáncer de tiroides (CT) es la malignidad endocrina más común, con una incidencia creciente a nivel mundial. El cáncer de tiroides papilar (CTP), una forma diferenciada de CT, representa aproximadamente el 90% de los CT y ocurre predominantemente en mujeres en edad fértil. Aunque responde a los tratamientos actuales, la recurrencia del CTP a la mediana edad es común y es mucho más refractaria al tratamiento. El CT no diferenciado, particularmente el cáncer de tiroides anaplásico (CTA), es el subtipo de CT más agresivo, caracterizado por ser resistente y no responder a todas las intervenciones terapéuticas y quirúrgicas. Además, el CTA es una de las malignidades más agresivas y letales entre todos los tipos de cáncer. A pesar de las diferencias en las necesidades terapéuticas entre los subtipos de CT diferenciados y no diferenciados, existe una necesidad crítica no satisfecha de identificar biomarcadores moleculares que puedan ayudar en el diagnóstico temprano, pronóstico y objetivos terapéuticos accionables para la intervención. Los avances en el campo de la genómica del cáncer han permitido la elucidación de patrones de expresión génica diferencial entre tumores y tejido sano. Una nueva categoría de moléculas, conocidas como ARN no codificantes, puede expresarse de manera diferencial y contribuir extensamente a la regulación al alza y a la baja de los genes que codifican proteínas, actuando como orquestadores maestros de los patrones de expresión génica regulada y desregulada. Estos ARN no codificantes han sido identificados por sus roles en la conducción de patrones carcinogénicos en varias etapas del desarrollo tumoral y se han convertido en objetivos atractivos para el estudio. La identificación de genes específicos que se expresan de manera diferencial puede proporcionar información sobre los mecanismos que impulsan los patrones carcinogénicos, llenando los vacíos en la decodificación de procesos moleculares y celulares que modulan los subtipos de CT, más allá de las mutaciones conductoras bien conocidas.