La Comisión Europea está dirigiendo esfuerzos para activar el almacenamiento de carbono en suelos agrícolas al fomentar la adopción de prácticas de agricultura de carbono en el marco del Pacto Verde Europeo y en otras políticas clave de la UE. Sin embargo, los agricultores que desean entrar en este modelo de producción necesitan urgentemente definir las prácticas sostenibles requeridas para aumentar el carbono orgánico del suelo sin alterar los sistemas de producción y también necesitan adaptarlas para optimizar los rendimientos y mejorar los stocks de carbono. Sin embargo, todavía falta herramientas que sean fáciles de usar e interpretar para guiar a los agricultores y partes interesadas a encontrar formas de aumentar el contenido de carbono orgánico del suelo. Por lo tanto, esta investigación tiene como objetivo establecer un enfoque novedoso de abajo hacia arriba, en términos de metodología y proceso de análisis, para identificar estrategias de gestión agrícola sostenibles a medida con el propósito de aumentar el carbono en el suelo. Investigamos 115 casos reales de producción de alimentos que se llevaron a cabo bajo condiciones pedo-climáticas homogéneas durante un período de 20 años en la región de Apulia (Italia del Sur), lo que permitió crear un conjunto de datos de 12 variables que fueron analizadas a través de un árbol de decisión (creado con el algoritmo C4.5). Los resultados generales destacan que la duración del tratamiento fue el factor más crucial y afectó el stock de carbono tanto positiva como negativamente. Esto fue seguido por el uso de cultivos de cobertura por sí solos y luego aquellos en combinación con un tipo de sistema de riego; por lo tanto, se identificaron con éxito estrategias de gestión agrícola específicas para obtener un almacenamiento efectivo de carbono en los casos reales de producción de alimentos considerados. Desde una perspectiva más amplia, esta investigación puede servir como guía para ayudar a los actores privados de la UE y a las autoridades públicas a iniciar iniciativas de agricultura de carbono, proyectos piloto o esquemas de certificación a nivel local y/o regional.