Las industrias de la acuicultura, y en particular la cría de peces y crustáceos, son importantes contribuyentes a la economía de muchos países y un componente cada vez más importante en el suministro global de alimentos. Sin embargo, el grave impacto de las enfermedades microbianas acuáticas en el rendimiento de la producción sigue siendo un desafío para estas industrias. Este artículo considera las posibles aplicaciones de la tecnología de microalgas en el control de tales enfermedades. En su nivel más simple, las microalgas ofrecen beneficios para la salud como suplemento nutricional en la alimentación debido a su digestibilidad y alto contenido de proteínas, lípidos y nutrientes esenciales. Además, algunas especies de microalgas poseen compuestos antimicrobianos naturales o contienen biomoléculas que pueden servir como inmunoestimulantes. Además, las tecnologías emergentes de ingeniería genética en microalgas ofrecen la posibilidad de producir "aditivos funcionales para la alimentación" en los que bioactivos novedosos y específicos, como hormonas de crecimiento de peces, antibacterianos, vacunas de subunidades y ARN interferentes dirigidos a virus, son componentes del suplemento algal. La evaluación de tales tecnologías para aplicaciones en granjas es un paso importante en el desarrollo futuro de la acuicultura sostenible.