Este estudio investiga la composición geológica y la distribución de materiales dentro del repositorio de Lavrio, ubicado en Grecia, a través de una encuesta de magnetometría aérea utilizando un novedoso dron aéreo, CERBERUS, junto con técnicas avanzadas de procesamiento de datos. El despliegue de la magnetometría basada en drones proporcionó un enfoque de alta resolución y no invasivo para capturar datos del campo magnético sobre terrenos complejos y potencialmente peligrosos (suelos altamente contaminados), facilitando la rápida y precisa cartografía del área de estudio. Como resultado final, se desarrolló un modelo de susceptibilidad magnética en 3D, que representa una vista detallada de las variaciones de susceptibilidad magnética dentro del repositorio. Este modelo permitió la visualización integral de zonas de alta susceptibilidad asociadas con materiales ferromagnéticos y zonas de baja susceptibilidad correlacionadas con materiales diamagnéticos como plomo, arsénico, cadmio y zinc. Las metodologías combinadas subrayan la efectividad de la magnetometría aérea basada en drones en estudios geofísicos, destacando su potencial para la exploración minera y la gestión de residuos. Este estudio demuestra que la integración de la tecnología de drones con el procesamiento de datos magnéticos ofrece una herramienta poderosa para analizar estructuras subsuperficiales de manera segura, eficiente y no invasiva.