La investigación de la diversidad taxonómica dentro de las comunidades de plantas insulares se erige como un enfoque central en el campo de la biogeografía insular. La diversidad filogenética es crucial para desentrañar la historia evolutiva, las funciones ecológicas y las combinaciones de especies dentro de las comunidades de plantas insulares. Los efectos insulares (efecto de área y de aislamiento) pueden moldear los patrones de distribución de especies, la heterogeneidad del hábitat afecta la diversidad del hábitat, y las perturbaciones antropogénicas pueden llevar a la extinción de especies y a la destrucción del hábitat, impactando así tanto la diversidad de especies como la diversidad filogenética. Para investigar cómo la diversidad taxonómica y filogenética en comunidades naturales de plantas insulares responde a los efectos insulares, la heterogeneidad del hábitat y las perturbaciones antropogénicas, tomamos la isla principal de Haitan (una isla de puente terrestre) y nueve islas circundantes (islas oceánicas) de diferentes tamaños como sujetos de nuestro estudio sobre las islas Pingtan. Nuestro objetivo es elucidar la influencia de los efectos insulares, la heterogeneidad del hábitat y las perturbaciones antropogénicas en la diversidad taxonómica y filogenética. Los resultados mostraron que, (1) tanto la diversidad taxonómica como la filogenética de las plantas en las islas Pingtan siguieron el efecto de área insular, indicando que a medida que aumenta el área de la isla, también aumentan la diversidad taxonómica y filogenética. (2) Se encontró que los efectos insulares y la heterogeneidad del hábitat mejoraban la diversidad taxonómica y filogenética, mientras que las perturbaciones antropogénicas estaban asociadas con una disminución de ambas diversidades. Además, la influencia sinérgica de los efectos insulares, la heterogeneidad del hábitat y las perturbaciones antropogénicas ejerció un impacto negativo en ambas diversidades. (3) La contribución de las variables explicativas de las perturbaciones antropogénicas para la diversidad taxonómica y filogenética fue mayor que la de los efectos insulares y la heterogeneidad del hábitat. Adicionalmente, la contribución de las variables explicativas bajo la influencia combinada de los efectos insulares, la heterogeneidad del hábitat y las perturbaciones antropogénicas es mayor que la de las variables individuales para los efectos insulares y la heterogeneidad del hábitat. Estos hallazgos sugieren que las perturbaciones antropogénicas emergieron como los factores dominantes que influyen tanto en la diversidad taxonómica como en la filogenética. Estos hallazgos demuestran la intrincada interacción entre los efectos insulares, la heterogeneidad del hábitat y las perturbaciones antropogénicas, destacando su influencia combinada en la diversidad taxonómica y filogenética en la isla.