Las papas son consideradas una fuente significativa de antioxidantes en la nutrición humana. Sin embargo, diferentes tipos de estrés ambiental pueden afectar el nivel de antioxidantes en su tejido tuberoso. En este estudio, se cultivaron dos clones de cría morados y el cultivar de pulpa amarilla (cv.) Agave en el invernadero bajo condiciones de control con estrés por sequía durante dos años consecutivos. Después de la cosecha, se analizaron los tubérculos para determinar las concentraciones de antioxidantes medidas como equivalente de ácido ascórbico (ACE) y equivalente de trolox (TXE) en tejido fresco y después de la herida. Además, se ensayaron las actividades de la enzima peroxidasa (POD) y las cantidades totales de antocianinas (Ac). El estrés por sequía causó una disminución significativa en el rendimiento de los tubérculos pero no tuvo un efecto significativo en Ac, POD, ACE y TXE. El estrés por heridas indujo significativamente la actividad de POD en los tubérculos de control y estresados por sequía de todos los genotipos. Además, el ACE y el TXE aumentaron notablemente por las heridas en cv. Agave. Esto fue menos pronunciado en los clones morados que en general mostraron un nivel más alto de antioxidantes. Los resultados revelaron diferencias significativas entre genotipos y que el efecto del estrés por sequía en el nivel de antioxidantes es menor que el del estrés por heridas.